Стефан Стоянов по всяка вероятност ще води мъжкия тим на Ботев до края на сезона, съобщава dsport. Той заменя на поста португалеца Бруно Балтазар, който се раздели с клуба след загубата с 1:2 от Арда в Кърджали. Стефан Стоянов ще проведе заниманието днес (25 май) от 11:00ч.

През 2010 година Стоянов започва работа в Ботев Пловдив. Водил е множество формации на "жълто-черната" школа. През сезон 2014/2015 е  треньор на набор 2001, с който печели Купата на БФС след победа на финала с 2:0 над Левски. През сезон 2015/2016 Стоянов отново води набор 2001 в новосформираната Елитна група до 15 години, като през този сезон печели Републиканското първенство след победа на финала над Черно море с изпълнение на дузпи.

През април 2017 година печели трето поредно отличие с родените за 2001 година, като триумфира с Купата на БФС след нова победа на финала над Левски.

През сезон 2017/2018 е треньор на набор 2001 в Елитната юношеска група до 17 години, където извежда тима до първото място и грабва златните медали.

В края на 2020 година за кратко бе начело на мъжкия отбор на Ботев. През  сезон 2021/2022  пое втория отбор на "жълто-черните", като пловдивчани стартираха отлично сезона, последва спад в представянето, но в крайна сметка запазиха мястото си във Втора лига.

Преди една година, на 24 май 2022, Стефан Стоянов напусна Ботев, след като двете страни прекратиха взаимоотношенията си по взаимно съгласие.