Нкунку е роден в Лани сюр Марн на 14 ноември 1997 г. и израства в академията на Пари Сен Жермен, като дебютира в първия отбор на клуба през 2015 г.

Той отбелязва 11 гола в 78 мача за парижкия гигант, спечелвайки три титли на Франция, две Купи на Франция, три Суперкупи на Франция и две титли от Купата на Лигата.

През лятото на 2019 г. той преминава в РБ Лайпциг, за който изиграва 172 мача и отбелязва 70 гола. През 2023 г. той се мести в Англия, за да се присъедини към Челси. Той завърши престоя си в Западен Лондон с 18 гола в 62 мача, като спечели Лигата на конференциите и Световното клубно първенство с Челси. Нкунку ще носи фланелката с №18 в Милан.

Милан ще привлече Нкунку под наем със закупуване срещу сума около 45 милиона евро.